医院拥有5位中国工程院院士，1百多名技术三级以上专家，1千多名高职专业技术人员。医院先后获得省部级以上科技成果奖励1300余项，其中，国家科技进步一等奖7项，二等奖20项，国家发明奖2项，军队科技进步一等奖21项。 [2]
2017年11月11日下午，复旦大学医院管理研究所正式发布了《2016年度中国医院排行榜》和《2016年度中国医院专科声誉排行榜》，中国人民解放军总医院名列第三。
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国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心是为加强我国耳鼻咽喉疾病医学科技创新体系建设、打造临床医学和转化研究的“高地”而创建的项目，目标是形成我国耳鼻咽喉疾病重大临床医学研究的“国家队”。
拟通过开展高质量循证医学研究、验证新技术和新方法、实施多学科交叉转化研究、开发和推广基层适宜技术、探索临床研究方法和管理模式，搭建国家耳鼻咽喉疾病临床研究公共技术支撑的平台。通过高质量临床多中心研究，出指南、出理论、出技术、出产品、出成效，为国家制定政策提供依据，以提高耳鼻咽喉疾病防控能力，改善民众健康。
坚持临床专科病理教学、理论授课、技能培训、科主任教学查房、疑难病例讨论，突出肾活检病理、血液透析、腹膜透析、CRRT等专科特色。现有博士生导师7人，硕士生导师13人，进修生指导老师54人，指导“四生”教学任务，培养研究生（含联合培养），博士后21人（6位获得博士后基金）、博士169人、硕士233人，规培生、进行生600余人。其中20人担任全国三级甲等医院的学科带头人，
获得军队博士论文1篇、硕士论文2篇，全国百篇博士论文提名1篇。毕业的学生获得求是杰出青年奖1名、中国青年科技奖2名、原总后科技新星2名、北京市科技新星6名。
作为教学示范窗口，接待到访国内外、军内外专家100余次。