28岁女患者林某，4个月前受凉后出现咽痛，后小便呈浓茶样，伴腰酸乏力，查尿蛋白+，两周前咽痛明显，曾予抗感染。4天前发热后再次出现茶色尿，医院检查病理提示IgA肾病，西药，尿色转清，但仍咽痛明显，遂求助于王永钧。王永钧给出中医治法养阴，清咽。开方14剂，加之西药同前，患者服用后咽痛如灼明显好转，继续服用中药14剂，加西药同前，患者未再有咽痛不适，加减方后调理一个月，复查尿蛋白-。
王永钧感到非常幸运，幸运的是自己打开了中西医这扇门，在中医上遇到的难题，西医能够给他启发。在我多人看来，学中医的人去学西医，就相当于另投门户，在古时候叫“背叛师门”。但是在王永钧看来，“良医是没有门户之见的，他学习西医，并不是改投门户，而是师夷长技，取长补短”。
中医看病就是望闻问切，四诊合参，而西医看病之前，就会依靠先进的仪器和工具检查疾病。传统中医肾病，主要是依靠中医“肉眼”去识别病症，所以王永钧和同事们经过大胆尝试，用一些先进的仪器，比如是免疫荧光、电子显微镜、光学显微镜等，来观察肾脏组织的病理变化。通过这些仪器的观察，能直接为肾脏的一些病症提供比较直观的数据。
在1986年的时候，王永钧被调到了杭州市中医院上班，在这里他创建了中医肾病专科门诊。王永钧带领着自己的团队，开创了国内中医院多项，比如说个建立肾病实验研究室，个使用肾穿刺活检技术，个开展系统的肾病透析疗法等等。