分类
按年度分类：将档案按其形成的年度分开，不同年度的档案分别整理。这种方法适用于大多数档案，能保持档案在时间上的连续性。
按机构分类：按照档案形成的机构或部门进行分类，便于查找和利用与特定机构相关的档案。
按问题分类：根据档案所反映的主题或问题进行分类，能集中反映某一特定问题的相关档案。
按保管期限分类：将档案按规定的保管期限进行分类，如、长期、短期，以便于档案的鉴定和销毁。
实际操作中，通常采用复式分类法，如年度 - 机构、年度 - 问题等组合方式。
保管和利用原则：档案整理要便于保管和利用。在整理过程中，应根据档案的载体类型、数量、重要程度等因素，选择合适的保管方式和装具，如档案盒、档案柜等，确保档案能够得到妥善保存。同时，整理后的档案应具有清晰的分类和编号体系，建立完善的检索工具和目录，方便档案管理人员快速查找和提供档案，满足利用者的需求。例如，将常用的档案放置在便于取用的位置，按照一定的分类规则排列，使利用者能够通过检索工具迅速找到所需档案。
按来源分类
组织机构分类法：按照档案形成的组织机构进行分类，将同一部门或单位形成的档案集中在一起。如政府机关中，不同科室形成的档案分别归类，能体现各部门的职能和工作范围，以及部门之间的协作关系。
作者分类法：以档案的作者为分类依据，将同一作者形成的档案归为一类。对于个人档案或一些特定作者群体的档案，这种分类方法有助于了解作者的思想、工作风格和学术成就等。
保持一致性和灵活性
一致性：在整个档案整理过程中，要保持主题和分类标准的一致性，避免出现同一类档案在不同部分采用不同分类标准的情况。这有助于建立统一的档案管理体系，方便档案的管理和利用。
灵活性：虽然要保持一致性，但也不能过于僵化，要根据档案的实际情况和特殊需求，适当调整和灵活运用分类标准。对于一些难以准确归类的档案，可以设置 “其他” 类别作为兜底，但要尽量减少此类情况的出现，确保分类体系的科学性和合理性。