每年的农历四至五月间，积雪溶化的时候，便是冬虫夏草采收的季节，此时冬虫夏草出苗未超过一寸，如果过了这个时节，则会苗枯死，其它杂草也会生长，冬虫夏草则踪影全无；冬虫草采收时要除去附在虫体上的黄色腊衣和其它杂质，凉干或晒干；传统的包装方法是以6～8条，用小红绳扎成一小捆（小子）。国内药用价值的虫草产于西藏那曲、昌都以及青海玉树、果洛这几个产地，这些产地位于海拔3000-4000米线，天然虫草素以及天然氨基酸含量。就品牌而言，国内的两个虫草品牌是福临门以及北京同仁堂，这两个品牌的冬虫夏草产自西藏那曲和青海玉树。如果是过节送礼，选用北京同仁堂比较合适，包装漂亮，价格也相应贵很多；如果是家人自己用，选福临门的冬虫夏草虽然价格也较高，但是相对实惠。
冬虫夏草的贮藏要求不高，一般来说，只要在产区，通过正常的干燥方法处理后，放在通风的环境下，是不会变质发霉的，如果太潮湿，可以考虑用密封袋包装后保存在冰箱内便可以了。